Département Ecologie aquatique

Je m’intéresse à comprendre les mécanismes génomiques qui génèrent et maintiennent la biodiversité en milieu aquatique. Spécifiquement, j’utilise un large panel de techniques génétiques et d’approches expérimentales pour découvrir comment les organismes s’adaptent à de nouvelles conditions environnementales, afin d’estimer leur vulnérabilité et résilience face à de rapides changements environnementaux. Ma recherche actuelle porte principalement sur des espèces natives et invasives de bivalves en Suisse, mais j’ai utilisé des systèmes d’étude variés dans le passé, comme les poissons, les échinodermes et les protistes.

Ma recherche est divisée en trois thèmes principaux :

1) (Épi)génomique de l’évolution contemporaine chez les bivalves

Les écosystèmes d’eau douce sont fortement impactés par les activités humaines. Ces activités mènent à la perte d’habitats, à la pollution et au changement climatique. Si les espèces ne peuvent atteindre des habitats plus favorables, elles subissent des pressions de sélection pour développer des stratégies adaptatives afin de pouvoir survivre dans ces nouvelles conditions environnementales. Je m’intéresse aux mécanismes génomiques et épigénomiques adaptatifs en réponse à la pollution et au changement climatique chez les espèces natives et invasives de bivalves.

2) Génomique de la conservation chez les moules d’eau douce

Malgré le fait qu’elles fournissent des services écosystémiques essentiels, les moules d’eau douce sont en fort déclin dans leur habitat naturel à cause d’une combinaison de plusieurs facteurs, incluant la perte d’habitats, l’impact des changements environnementaux et la compétition avec les espèces invasives. La génomique offre de puissants outils pour comprendre la vulnérabilité et la résilience des populations, cependant il n’existe que peu de ressources génomiques pour ces espèces actuellement. Je prévois de séquencer le génome de toutes les espèces de moule d’eau douce présentes en Suisse, et de mener des études de génomique des populations pour développer et implémenter des stratégies de conservation sur le long terme.

3) Développement d’outils et de connaissances pour le biocontrôle génétique des bivalves invasifs

Les espèces aquatiques invasives, comme les moules Quagga et zébrées, sont une menace pour la biodiversité locale, mais elles génèrent également des coûts élevés pour contenir leur propagation, par exemple dans les stations d’épuration ou les centrales électriques. Ce dernier thème de recherche a pour but de développer des outils et des connaissances pour un éventuel biocontrôle génétique des bivalves invasifs en Suisse. Mon projet actuel est focalisé sur la découverte du type de système de détermination du sexe chez les moules zébrées et Quagga. Cette information sera cruciale pour développer des mesures de biocontrôle génétique appropriées dans le futur.