Abteilung Umweltmikrobiologie

Das Leben, wie wir es kennen, ist eng mit Mikroorganismen verbunden. Oft leben diese Mikroorganismen in Gemeinschaften, die Mikrobiome genannt werden. Mikrobiome sind mehr als die Summe ihrer Teile und haben Funktionen und Aufgaben, die sich nicht so einfach vorhersagen lassen. Sie spielen eine wichtige Rolle bei der Gestaltung der menschlichen Gesundheit, der biogeochemischen Kreisläufe, der landwirtschaftlichen Produktivität und der Ernährung und berühren nahezu jeden Aspekt unseres Lebens. 

In Zusammenarbeit mit über 20 Forschungsgruppen aus der ganzen Schweiz kombinieren wir computergestützte und experimentelle Ansätze, um besser zu verstehen, wie Mikrobiome entstehen und funktionieren. Die Entdeckungen, die durch diese Forschung gemacht werden, können uns helfen, die Gesundheit von Mensch und Umwelt zu verbessern. 

Unser Hauptbeitrag zu diesem Konsortium besteht zum einen in der Entwicklung neuer Konzepte, die die treibenden Kräfte der metabolischen Interaktionen zwischen den Mitgliedern eines Mikrobioms beschreiben, und in der Prüfung der daraus abgeleiteten Hypothesen durch computergestützte Modellierung und Analyse großer Datensätze von Mikrobiomproben aus der Umwelt. Andererseits arbeiten wir daran, die Faktoren besser zu verstehen, die zur funktionellen Stabilität in mikrobiellen Gemeinschaften beitragen, insbesondere die relative Bedeutung funktioneller Redundanz sowie schwacher und negativer Wechselwirkungen. Bei dieser Arbeit werden synthetische mikrobielle Gemeinschaften und bildgebende Verfahren mit hohem Durchsatz eingesetzt, um unser Verständnis dessen, was mikrobielle Systeme formt, aufrechterhält und definiert, zu verbessern.