Hier untersuchen wir die genetische Architektur eines Schlüsselmerkmals, das an der Verhaltensisolation beteiligt ist, die männliche Hochzeitsfärbung, indem wir zwei Schwesterartenpaare von Viktoriasee-Buntbarschen der Gattung Pundamilia kreuzen und die Hochzeitsfärbung in den F2-Hybriden kartieren. Bei der einen Art handelt es sich um ein junges sympatrisches Artenpaar, das für eine Achse der Farbmotivdifferenzierung, nämlich Rot-Rücken versus Blau, repräsentativ ist, die bei eng verwandten sympatrischen Arten häufig vorkommt. Bei dem anderen handelt es sich um ein Artenpaar, das für Farbmotive steht, die bei allopatrischen Arten häufig, bei sympatrischen, eng verwandten Arten jedoch selten sind: Rot-Brust versus Blau. Wir finden signifikante quantitative Merkmalsloci (QTLs) mit mäßigen bis großen Effekten (teilweise überlappend) für Rot und Gelb in der sympatrischen Kreuzung Rot-Rücken × Blau, während wir in der nicht-sympatrischen Kreuzung Rot-Brust × Blau keine signifikanten QTLs finden. Diese Ergebnisse stimmen mit der Theorie überein, die besagt, dass Loci mit großen Effekten oder Kopplung/Priotropie, die der Differenzierung von Paarungsmerkmalen zugrunde liegen, die Artbildung und das Fortbestehen von Arten mit Genfluss in Sympatrie erleichtern könnten.